Für Baumschulen, die Gehölze in Töpfen und Containern produzieren, sind Versuche zur Prüfung bzw. Untersuchung von Düngern und Substraten wesentliche Themen der Versuchsarbeit. Zu diesem Themenkomplex führt das Baumschulkompetenzzentrum in Ellerhoop folgende Versuche durch:
Auch für die Baumschulen, die Gehölze im Freiland produzieren, werden Versuchsfragen zur Düngung in Ellerhoop bearbeitet.
Aktuell wird zum Beispiel die Eignung von Gärresten aus Biogasanlagen als Alternative zur organischen Düngung mit Stallmist in der Gehölzproduktion geprüft.